Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D4W2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D4W2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D4W2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D4W2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D4W2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9D4W2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D4W2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms