Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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H2al3Q9D4U4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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H2al3Q9D4U4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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H2al3Q9D4U4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al3Q9D4U4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al3Q9D4U4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al3Q9D4U4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al3Q9D4U4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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