Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms