Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Snrnp35Q9D384 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrnp35Q9D384 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms