Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef12Q9D2F1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pramef12Q9D2F1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms