Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syf2Q9D198 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms