Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Susd3Q9D176 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Susd3Q9D176 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms