Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms