Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snu13Q9D0T1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snu13Q9D0T1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snu13Q9D0T1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snu13Q9D0T1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snu13Q9D0T1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snu13Q9D0T1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snu13Q9D0T1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snu13Q9D0T1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snu13Q9D0T1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snu13Q9D0T1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snu13Q9D0T1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snu13Q9D0T1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snu13Q9D0T1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snu13Q9D0T1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Snu13Q9D0T1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snu13Q9D0T1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms