Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lsm12Q9D0R8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms