Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf2e1Q9D0D5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms