Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spc24Q9D083 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spc24Q9D083 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spc24Q9D083 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spc24Q9D083 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spc24Q9D083 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spc24Q9D083 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spc24Q9D083 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spc24Q9D083 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spc24Q9D083 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spc24Q9D083 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spc24Q9D083 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spc24Q9D083 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spc24Q9D083 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms