Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrs1Q9CYH6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms