Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nip7Q9CXK8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms