Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp23Q9CX11 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms