Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tdrd12Q9CWU0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms