Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca4Q9CWM2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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