Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms