Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWB5

Pgpep1l, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1lQ9CWB5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Pgpep1lQ9CWB5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgpep1lQ9CWB5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Pgpep1lQ9CWB5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Pgpep1lQ9CWB5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Pgpep1lQ9CWB5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Pgpep1lQ9CWB5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1lQ9CWB5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pgpep1lQ9CWB5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pgpep1lQ9CWB5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1lQ9CWB5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1lQ9CWB5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1lQ9CWB5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1lQ9CWB5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1lQ9CWB5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1lQ9CWB5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1lQ9CWB5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1lQ9CWB5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgpep1lQ9CWB5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pgpep1lQ9CWB5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms