Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl3Q9CUS9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl3Q9CUS9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl3Q9CUS9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms