Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smurf1Q9CUN6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smurf1Q9CUN6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms