Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud1Q9CUB6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms