Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d3Q9CSV6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms