Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dis3Q9CSH3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dis3Q9CSH3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dis3Q9CSH3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms