Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5sQ9CRA7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms