Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms