Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ykt6Q9CQW1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms