Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rer1Q9CQU3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rer1Q9CQU3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rer1Q9CQU3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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