Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms