Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Mrpl35Q9CQL6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl35Q9CQL6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl35Q9CQL6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl35Q9CQL6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl35Q9CQL6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl35Q9CQL6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl35Q9CQL6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl35Q9CQL6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl35Q9CQL6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl35Q9CQL6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl35Q9CQL6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl35Q9CQL6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl35Q9CQL6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl35Q9CQL6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl35Q9CQL6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl35Q9CQL6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl35Q9CQL6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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