Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp2Q9CQ73 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp2Q9CQ73 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms