Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpa3Q9CQ71 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpa3Q9CQ71 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms