Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms