Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4930519G04RikQ9CPT7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms