Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim8Q99PJ2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim8Q99PJ2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms