Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH7

Slc26a5, Prestin, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a5Q99NH7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc26a5Q99NH7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc26a5Q99NH7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc26a5Q99NH7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc26a5Q99NH7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc26a5Q99NH7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc26a5Q99NH7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc26a5Q99NH7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc26a5Q99NH7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc26a5Q99NH7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms