Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Bco2Q99NF1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Bco2Q99NF1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Bco2Q99NF1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Bco2Q99NF1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Bco2Q99NF1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bco2Q99NF1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
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Bco2Q99NF1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bco2Q99NF1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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