Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rims1Q99NE5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rims1Q99NE5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms