Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcgf6Q99NA9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms