Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brms1Q99N20 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brms1Q99N20 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms