Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a6dQ99N07 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a6dQ99N07 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms