Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprtQ99M80 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprtQ99M80 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms