Protein–RNA interactions for Protein: Q99M01

Fars2, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fars2Q99M01 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fars2Q99M01 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms