Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp5lQ99LH9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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