Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcf2Q99LE6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcf2Q99LE6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcf2Q99LE6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms