Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Reep3Q99KK1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep3Q99KK1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms