Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ufsp2Q99K23 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp2Q99K23 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms