Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg5Q99J83 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg5Q99J83 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms