Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec3Q99J72 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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