Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim11aQ99J19 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim11aQ99J19 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms